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こちら私の環境で動かした"Add all missing foreign keys"対応用SQLとmirgration出力となります。
SQL: https://pastebin.com/GpbtGmbU
Migration output: https://pastebin.com/y4uwEt8t
とりあえずPullReqのところに投げておいたです
多分環境によっていらなかったり別のテーブルにも実行しないとだめな場合ありそう